毛細管色譜柱安裝和系統檢漏工作完成后，就可以對色譜柱進行老化，對色譜柱加熱至恒定溫度，通常取其使用溫度上限，超過色譜柱的溫度上限極易損壞色譜柱。當達到老化溫度后，記錄并觀察基線，初始階段基線應持續上升，在達到老化溫度后5-10min開始下降，并且會持續30-90分鐘。當達到一個固定的值后，就會穩定下來。如果在2-3個小時后基線仍無法穩定，或者在15-20分鐘后仍無明顯的下降趨勢，那么有可能系統裝置有泄漏或者污染。遇到這樣的情況，應該立即將柱溫降到40度以下，盡快的檢查系統并解決相關的問題。如果繼續老化，不僅對色譜柱有損壞，而且始終得不到正常穩定的基線。

　　一般來講，涂有極性固定相和較厚涂層的色譜柱老化時間較長，貳弱極性固定相和較薄涂層的色譜柱所需老化時間較短。而PLOT色譜柱的老化方法又各不相同。需按照毛細管色譜柱供應商提供的老化條件進行老化。在色譜柱老化過程結束后，采用程序升溫做一次空白試驗，一般是從40℃/min從50℃升到高使用溫度，達到高使用溫度后保持10min，這樣我們會得到一張流失圖，這些數值可以后作對比試驗，并且對實驗問題的解決有幫助。

　　在空白試驗的色譜圖中，不應該有色譜峰出現，如果出現了色譜峰，通常可能拾從進樣口帶來的污染物，如果在正常使用狀態下，色譜柱性能開始下降，基線的信號值會增高，另外，如果在較低的溫度下，色譜柱的保存用進樣墊將色譜柱的兩端封住，并放回原包裝，再次安裝時要將色譜柱的兩端截去一部分，保證沒有進樣墊的碎屑殘留于柱中。